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转录因子基因组探索者

文章作者:优博时时彩平台开户发布时间:2019-12-24浏览次数:1825

转录因子(TFs)是调节基因转录的蛋白质,这是制造蛋白质的第一步。 TF的工作方式是搜索整个基因组并与调控基因的特定区域结合,使它们“开启”或“关闭”。已知TF不仅结合特定的DNA序列,还结合非特异性DNA结合。

这种非特异性结合可以显着增加TF通过允许它们沿着DNA滑动而找到其特定靶位点的能力。然而,我们不了解超过1,500个人类TF在效率上如何改变以扫描大量基因组,定位和结合特定位点。

现在,EPFL生物工程研究所的David Suter实验室已经找到了一种方法来预测不同TF在扫描活细胞基因组中的效率。他们的研究结果发表在Nature Communications杂志上。科学家通过研究它们如何与“有丝分裂”染色体结合来研究小鼠中的501个TF,这是一种与TF以非特异性方式结合DNA的能力相关的特性。

利用光漂白实验和单分子成像,科学家们已经发现TFs在细胞核中的运动及其在寻找结合位点的效率可以通过有丝分裂染色体结合来预测。

通过将这些实验与全基因组中的TF作图相结合,他们发现不同的TF在发现其位点的能力上有三个数量级的变化。因此,具有强非特异性DNA结合特性的TF与有丝分裂染色体结合,在细胞核中缓慢移动,并且特别有效地发现它们需要结合的特定序列以调节基因表达。

“转向因子在扫描基因组以找到其特异性结合位点的能力差异很大,这些差异可以通过简单地观察它们与有丝分裂染色体结合的程度来预测,”David Suter说。 “即使以低浓度表达,在基因组中寻找最有效的转录因子也可以推动基因表达模式的广泛变化,因此对细胞命运决策过程尤为重要。”

本文由EPFL生物工程研究所提供的材料重新发表。注意:材料可能已根据长度和内容进行了编辑。有关详细信息,请联系参考资料来源。

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